যক্ষ্মা রোগ নির্ণয় এবং ওষুধ প্রতিরোধ সনাক্তকরণের জন্য একটি নতুন অস্ত্র: যক্ষ্মা অতি সংবেদনশীলতা নির্ণয়ের জন্য মেশিন লার্নিংয়ের সাথে মিলিত একটি নতুন প্রজন্মের লক্ষ্যযুক্ত সিকোয়েন্সিং (tNGS)
সাহিত্য প্রতিবেদন: CCa: tNGS এবং মেশিন লার্নিংয়ের উপর ভিত্তি করে একটি ডায়াগনস্টিক মডেল, যা কম ব্যাকটেরিয়াজনিত যক্ষ্মা এবং যক্ষ্মা মেনিনজাইটিসে আক্রান্ত ব্যক্তিদের জন্য উপযুক্ত।
থিসিসের শিরোনাম: যক্ষ্মা-লক্ষ্যযুক্ত পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং এবং মেশিন লার্নিং: প্যাসিফিক পালমোনারি টিউবুলার এবং টিউবুলার মেনিনজাইটিসের জন্য একটি অতি-সংবেদনশীল ডায়াগনস্টিক কৌশল।
পর্যায়ক্রমিক: 《ক্লিনিকা চিমিকা অ্যাক্টা》
যদি: ৬.৫
প্রকাশের তারিখ: জানুয়ারী ২০২৪
চাইনিজ একাডেমি অফ সায়েন্সেস বিশ্ববিদ্যালয় এবং ক্যাপিটাল মেডিকেল বিশ্ববিদ্যালয়ের বেইজিং চেস্ট হাসপাতালের সাথে মিলিত হয়ে, ম্যাক্রো অ্যান্ড মাইক্রো-টেস্ট নতুন প্রজন্মের টার্গেটেড সিকোয়েন্সিং (tNGS) প্রযুক্তি এবং মেশিন লার্নিং পদ্ধতির উপর ভিত্তি করে একটি যক্ষ্মা রোগ নির্ণয় মডেল প্রতিষ্ঠা করেছে, যা অল্প ব্যাকটেরিয়া এবং যক্ষ্মা মেনিনজাইটিস সহ যক্ষ্মা রোগের জন্য অতি-উচ্চ সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা প্রদান করেছে, দুই ধরণের যক্ষ্মা রোগের ক্লিনিকাল নির্ণয়ের জন্য একটি নতুন অতি সংবেদনশীলতা নির্ণয় পদ্ধতি প্রদান করেছে এবং যক্ষ্মা রোগের সঠিক নির্ণয়, ওষুধ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ এবং চিকিৎসায় সহায়তা করেছে। একই সাথে, এটি পাওয়া গেছে যে রোগীর প্লাজমা সিএফডিএনএ টিবিএম রোগ নির্ণয়ের ক্ষেত্রে ক্লিনিকাল নমুনার জন্য উপযুক্ত নমুনা প্রকার হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে।
এই গবেষণায়, ২২৭টি প্লাজমা নমুনা এবং সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড নমুনা দুটি ক্লিনিক্যাল কোহর্ট স্থাপনের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল, যেখানে ল্যাবরেটরি ডায়াগনস্টিক কোহর্ট নমুনাগুলি যক্ষ্মা রোগ নির্ণয়ের মেশিন লার্নিং মডেল স্থাপনের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল এবং ক্লিনিক্যাল ডায়াগনস্টিক কোহর্ট নমুনাগুলি প্রতিষ্ঠিত ডায়াগনস্টিক মডেল যাচাই করার জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল। সমস্ত নমুনা প্রথমে মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকুলোসিসের জন্য একটি বিশেষভাবে ডিজাইন করা টার্গেটেড ক্যাপচার প্রোব পুল দ্বারা লক্ষ্য করা হয়েছিল। তারপরে, TB-tNGS সিকোয়েন্সিং ডেটার উপর ভিত্তি করে, ডিসিশন ট্রি মডেলটি ল্যাবরেটরি ডায়াগনস্টিক কিউ-এর প্রশিক্ষণ এবং বৈধতা সেটগুলিতে ৫-গুণ ক্রস-বৈধকরণ সম্পাদনের জন্য ব্যবহার করা হয় এবং প্লাজমা নমুনা এবং সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড নমুনার ডায়াগনস্টিক থ্রেশহোল্ড প্রাপ্ত করা হয়। প্রাপ্ত থ্রেশহোল্ডটি সনাক্তকরণের জন্য ক্লিনিক্যাল ডায়াগনস্টিক কিউ-এর দুটি পরীক্ষার সেটে আনা হয় এবং শিক্ষার্থীর ডায়াগনস্টিক কর্মক্ষমতা ROC বক্ররেখা দ্বারা মূল্যায়ন করা হয়। অবশেষে, যক্ষ্মা রোগ নির্ণয়ের মডেলটি প্রাপ্ত করা হয়েছিল।
চিত্র ১ গবেষণা নকশার পরিকল্পিত চিত্র
ফলাফল: এই গবেষণায় নির্ধারিত CSF DNA নমুনা (AUC = 0.974) এবং প্লাজমা cfDNA নমুনা (AUC = 0.908) এর নির্দিষ্ট থ্রেশহোল্ড অনুসারে, 227 টি নমুনার মধ্যে, CSF নমুনার সংবেদনশীলতা ছিল 97.01%, নির্দিষ্টতা ছিল 95.65%, এবং প্লাজমা নমুনার সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতা ছিল 82.61% এবং 86.36%। TBM রোগীদের প্লাজমা cfDNA এবং সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড DNA এর 44 টি জোড়া নমুনার বিশ্লেষণে, এই গবেষণার ডায়াগনস্টিক কৌশলটি প্লাজমা cfDNA এবং সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড DNA তে 90.91% (40/44) এর উচ্চ সামঞ্জস্যতা রয়েছে এবং সংবেদনশীলতা 95.45% (42/44)। পালমোনারি যক্ষ্মা আক্রান্ত শিশুদের ক্ষেত্রে, এই গবেষণার রোগ নির্ণয়ের কৌশলটি একই রোগীদের গ্যাস্ট্রিক রসের নমুনার Xpert সনাক্তকরণ ফলাফলের তুলনায় প্লাজমা নমুনার প্রতি বেশি সংবেদনশীল (২৮.৫৭% বনাম ১৫.৩৮%)।
চিত্র ২ জনসংখ্যার নমুনার জন্য যক্ষ্মা রোগ নির্ণয় মডেলের বিশ্লেষণ কর্মক্ষমতা
চিত্র ৩ জোড়া নমুনার ডায়াগনস্টিক ফলাফল
উপসংহার: এই গবেষণায় যক্ষ্মার জন্য একটি অতি সংবেদনশীল রোগ নির্ণয় পদ্ধতি প্রতিষ্ঠিত হয়েছে, যা অলিগোব্যাসিলারি যক্ষ্মা (নেতিবাচক কালচার) আক্রান্ত ক্লিনিকাল রোগীদের জন্য সর্বোচ্চ সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা সহ একটি রোগ নির্ণয়ের সরঞ্জাম সরবরাহ করতে পারে। প্লাজমা সিএফডিএনএ-এর উপর ভিত্তি করে অতি সংবেদনশীল যক্ষ্মা সনাক্তকরণ সক্রিয় যক্ষ্মা এবং যক্ষ্মা মেনিনজাইটিস নির্ণয়ের জন্য একটি উপযুক্ত নমুনা ধরণের হতে পারে (মস্তিষ্কের যক্ষ্মা সন্দেহভাজন রোগীদের জন্য সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইডের চেয়ে প্লাজমা নমুনা সংগ্রহ করা সহজ)।
মূল লিঙ্ক: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্ট যক্ষ্মা সিরিজ সনাক্তকরণ পণ্যের সংক্ষিপ্ত ভূমিকা
যক্ষ্মা রোগীদের জটিল নমুনা পরিস্থিতি এবং বিভিন্ন চাহিদার পরিপ্রেক্ষিতে, ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্ট থুতনির নমুনা থেকে তরলীকরণ নিষ্কাশন, কোয়ালকম লাইব্রেরি নির্মাণ এবং সিকোয়েন্সিং এবং ডেটা বিশ্লেষণের জন্য এনজিএস সমাধানের একটি সম্পূর্ণ সেট সরবরাহ করে। পণ্যগুলি যক্ষ্মা রোগীদের দ্রুত রোগ নির্ণয়, যক্ষ্মা রোগের ওষুধ প্রতিরোধের সনাক্তকরণ, মাইকোব্যাকটেরিয়াম যক্ষ্মা এবং এনটিএম টাইপিং, ব্যাকটেরিয়া-নেগেটিভ যক্ষ্মা এবং যক্ষ্মা রোগীদের অতি সংবেদনশীলতা নির্ণয় ইত্যাদি অন্তর্ভুক্ত করে।
যক্ষ্মা এবং মাইকোব্যাকটেরিয়ার জন্য সিরিয়াল সনাক্তকরণ কিট:
| আইটেম নংঃ | পণ্যের নাম | পণ্য পরীক্ষার বিষয়বস্তু | নমুনার ধরণ | প্রযোজ্য মডেল |
| এইচডব্লিউটিএস-৩০১২ | নমুনা মুক্তি এজেন্ট | থুতুর নমুনার তরলীকরণ চিকিৎসায় ব্যবহৃত, সুটং মেশিনারি ইকুইপমেন্ট 20230047 নামে একটি প্রথম-শ্রেণীর রেকর্ড নম্বর পেয়েছে। | থুতনি | |
| এইচডব্লিউটিএস-এনজিএস-পি০০০২১ | অতি সংবেদনশীল যক্ষ্মার জন্য কোয়ালকম পরিমাণ সনাক্তকরণ কিট (প্রোব ক্যাপচার পদ্ধতি) | ব্যাকটেরিয়া-নেগেটিভ পালমোনারি টিউবারকুলোসিস এবং মস্তিষ্কের নোডুলসের জন্য নন-ইনভেসিভ (তরল বায়োপসি) হাইপারসেনসিটিভিটি সনাক্তকরণ; যক্ষ্মা বা নন-টিউবারকুলোসিস মাইকোব্যাকটেরিয়ায় আক্রান্ত বলে সন্দেহ করা ব্যক্তিদের নমুনাগুলি উচ্চ-গভীরতা ক্রম মেটাজেনমিক্স দ্বারা বিশ্লেষণ করা হয়েছিল এবং যক্ষ্মা বা নন-টিউবারকুলোসিস মাইকোব্যাকটেরিয়া সংক্রামিত কিনা তা সনাক্তকরণ তথ্য এবং মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকুলোসিসের প্রধান প্রথম-সারির ওষুধ প্রতিরোধের তথ্য সরবরাহ করা হয়েছিল। | পেরিফেরাল রক্ত, অ্যালভিওলার ল্যাভেজ তরল, হাইড্রোথোরাক্স এবং অ্যাসাইটস, ফোকাস পাংচার নমুনা, সেরিব্রোস্পাইনাল তরল। | দ্বিতীয় প্রজন্ম |
| এইচডব্লিউটিএস-এনজিএস-টি০০১ | মাইকোব্যাকটেরিয়াম টাইপিং এবং ড্রাগ রেজিস্ট্যান্স সনাক্তকরণ কিট (মাল্টিপ্লেক্স অ্যামপ্লিফিকেশন সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি) | মাইকোব্যাকটেরিয়াম টাইপিং পরীক্ষা, যার মধ্যে রয়েছে MTBC এবং 187 NTM；মাইকোব্যাকটেরিয়াম যক্ষ্মার ওষুধ প্রতিরোধী সনাক্তকরণ ১৩টি ওষুধ এবং ওষুধ প্রতিরোধী জিনের ১৬টি মূল মিউটেশন সাইটকে অন্তর্ভুক্ত করে। | থুতনি, অ্যালভিওলার ল্যাভেজ ফ্লুইড, হাইড্রোথোরাক্স এবং অ্যাসাইটস, ফোকাস পাংচার নমুনা, সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড। | দ্বিতীয়/তৃতীয় প্রজন্মের ডুয়াল প্ল্যাটফর্ম |
হাইলাইটস: HWTS-NGS-T001 মাইকোব্যাকটেরিয়াম টাইপিং এবং ড্রাগ রেজিস্ট্যান্স সনাক্তকরণ কিট (মাল্টিপ্লেক্স অ্যামপ্লিফিকেশন পদ্ধতি)
পণ্য পরিচিতি
এই পণ্যটি WHO-এর যক্ষ্মা চিকিৎসা নির্দেশিকায় বর্ণিত প্রধান প্রথম এবং দ্বিতীয় সারির ওষুধ, NTM চিকিৎসা নির্দেশিকায় সাধারণত ব্যবহৃত ম্যাক্রোলাইড এবং অ্যামিনোগ্লাইকোসাইডের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয়েছে, এবং ওষুধ প্রতিরোধের স্থানগুলি WHO মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকুলোসিস কমপ্লেক্স মিউটেশন ক্যাটালগের সমস্ত ওষুধ প্রতিরোধ-সম্পর্কিত স্থানগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করে, সেইসাথে দেশে এবং বিদেশে উচ্চ-স্কোরিং সাহিত্যের তদন্ত এবং পরিসংখ্যান অনুসারে অন্যান্য রিপোর্ট করা ওষুধ প্রতিরোধের জিন এবং মিউটেশন সাইটগুলিকেও অন্তর্ভুক্ত করে।
টাইপিং শনাক্তকরণ চীনা জার্নাল অফ টিউবারকুলোসিস অ্যান্ড রেসপিরেটরি ডিজিজেস দ্বারা প্রকাশিত NTM নির্দেশিকাগুলিতে সংক্ষিপ্ত NTM স্ট্রেন এবং বিশেষজ্ঞদের ঐক্যমত্যের উপর ভিত্তি করে তৈরি। ডিজাইন করা টাইপিং প্রাইমারগুলি 190 টিরও বেশি NTM প্রজাতিকে প্রশস্ত, ক্রমানুসার এবং টীকাবদ্ধ করতে পারে।
টার্গেটেড মাল্টিপ্লেক্স পিসিআর অ্যামপ্লিফিকেশন প্রযুক্তির মাধ্যমে, মাল্টিপ্লেক্স পিসিআর দ্বারা মাইকোব্যাকটেরিয়ামের জিনোটাইপিং জিন এবং ড্রাগ-প্রতিরোধী জিনগুলিকে অ্যামপ্লিফাই করা হয়েছিল এবং সনাক্ত করা লক্ষ্য জিনের অ্যামপ্লিকন সংমিশ্রণ প্রাপ্ত হয়েছিল। অ্যামপ্লিফাই করা পণ্যগুলিকে দ্বিতীয়-প্রজন্ম বা তৃতীয়-প্রজন্মের উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরিতে তৈরি করা যেতে পারে এবং সমস্ত দ্বিতীয়-প্রজন্ম এবং তৃতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মগুলিকে টার্গেট জিনের সিকোয়েন্স তথ্য পেতে উচ্চ-গভীরতা সিকোয়েন্সিংয়ের শিকার করা যেতে পারে। বিল্ট-ইন রেফারেন্স ডাটাবেসে থাকা পরিচিত মিউটেশনগুলির সাথে তুলনা করে (WHO মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকুলোসিস কমপ্লেক্স মিউটেশন ক্যাটালগ এবং ড্রাগ প্রতিরোধের সাথে এর সম্পর্ক সহ), যক্ষ্মা-বিরোধী ওষুধের ড্রাগ প্রতিরোধ বা সংবেদনশীলতার সাথে সম্পর্কিত মিউটেশনগুলি নির্ধারণ করা হয়েছিল। ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্টের স্ব-খোলা থুতু নমুনা চিকিত্সা সমাধানের সাথে মিলিত হয়ে, ক্লিনিকাল থুতু নমুনার কম নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধন দক্ষতার সমস্যা (ঐতিহ্যগত পদ্ধতির তুলনায় দশ গুণ বেশি) সমাধান করা হয়েছিল, যাতে ড্রাগ প্রতিরোধের সিকোয়েন্সিং সনাক্তকরণ সরাসরি ক্লিনিকাল থুতু নমুনায় প্রয়োগ করা যেতে পারে।
পণ্য সনাক্তকরণ পরিসীমা
34ওষুধ প্রতিরোধের সাথে সম্পর্কিত জিন18যক্ষ্মা প্রতিরোধী ওষুধ এবং6এনটিএম ওষুধ সনাক্ত করা হয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে২৯৭ওষুধ প্রতিরোধের স্থান; দশ ধরণের মাইকোব্যাকটেরিয়াম যক্ষ্মা এবং আরও অনেক কিছু১৯০বিভিন্ন ধরণের NTM সনাক্ত করা হয়েছে।
সারণি ১: ১৮+৬টি ওষুধের তথ্য +১৯০+এনটিএম
পণ্যের সুবিধা
শক্তিশালী ক্লিনিক্যাল অভিযোজনযোগ্যতা: কফের নমুনাগুলি কালচার ছাড়াই স্ব-তরলীকরণ এজেন্ট দিয়ে সরাসরি সনাক্ত করা যেতে পারে।
পরীক্ষামূলক কার্যক্রমটি সহজ: প্রথম রাউন্ডের পরিবর্ধন কার্যক্রম সহজ, এবং লাইব্রেরি নির্মাণ ৩ ঘন্টার মধ্যে সম্পন্ন হয়, যা কাজের দক্ষতা উন্নত করে।
ব্যাপক টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধ: MTB এবং NTM-এর টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধের স্থানগুলি কভার করা, যা ক্লিনিকাল উদ্বেগের মূল বিষয়, সঠিক টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধের সনাক্তকরণ, স্বাধীন বিশ্লেষণ সফ্টওয়্যার সমর্থন করে এবং এক ক্লিকে বিশ্লেষণ প্রতিবেদন তৈরি করে।
সামঞ্জস্যতা: পণ্যের সামঞ্জস্যতা, মূলধারার ILM এবং MGI/ONT প্ল্যাটফর্মের সাথে খাপ খাইয়ে নেওয়া।
পণ্যের বিবরণ
| পণ্য কোড | পণ্যের নাম | সনাক্তকরণ প্ল্যাটফর্ম | স্পেসিফিকেশন |
| এইচডব্লিউটিএস-এনজিএস-টি০০১ | মাইকোব্যাকটেরিয়াম টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধের সনাক্তকরণ কিট (মাল্টিপ্লেক্স পরিবর্ধন পদ্ধতি) | ONT、Illumina、MGI、Salus pro | ১৬/৯৬আরএক্সএন |
পোস্টের সময়: জানুয়ারী-২৩-২০২৪