যক্ষ্মা রোগ নির্ণয় এবং ওষুধ প্রতিরোধ সনাক্তকরণের জন্য একটি নতুন অস্ত্র: যক্ষ্মা হাইপারস্পেনসিটিভিটি ডায়াগনোসিসের জন্য মেশিন লার্নিংয়ের সাথে মিলিত একটি নতুন প্রজন্মের টার্গেটেড সিকোয়েন্সিং (টিএনজিএস)
সাহিত্যের প্রতিবেদন: সিসিএ: টিএনজিএস এবং মেশিন লার্নিংয়ের উপর ভিত্তি করে একটি ডায়াগনস্টিক মডেল, যা কম ব্যাকটিরিয়া যক্ষ্মা এবং যক্ষ্মা মেনিনজাইটিসযুক্ত লোকদের জন্য উপযুক্ত।
থিসিস শিরোনাম: যক্ষ্মা-লক্ষ্যযুক্ত পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং এবং মেশিন লার্নিং: পকফিক পালমোনারি টিউবুলার এবং টিউবুলার মেনিনজাইটিসের জন্য একটি অতি সংবেদনশীল ডায়াগনস্টিক কৌশল।
সাময়িকী: 《ক্লিনিকা চিমিকা অ্যাক্টা》
যদি : 6.5
প্রকাশের তারিখ: জানুয়ারী 2024
ইউনিভার্সিটি অফ চীনা একাডেমি অফ সায়েন্সেস এবং বেইজিং চেস্ট হাসপাতালের ক্যাপিটাল মেডিকেল বিশ্ববিদ্যালয়ের সাথে মিলিত, ম্যাক্রো অ্যান্ড মাইক্রো-টেস্ট নতুন প্রজন্মের টার্গেট সিকোয়েন্সিং (টিএনজিএস) প্রযুক্তি এবং মেশিন লার্নিং পদ্ধতির উপর ভিত্তি করে একটি যক্ষ্মা নির্ণয়ের মডেল প্রতিষ্ঠা করেছে, যা অতি-উচ্চ-উচ্চ সরবরাহ করেছিল কয়েকটি ব্যাকটিরিয়া এবং যক্ষ্মা মেনিনজাইটিস সহ যক্ষ্মার জন্য সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা, দুটি ধরণের ক্লিনিকাল ডায়াগনোসিসের জন্য একটি নতুন হাইপারস্পেনসিটিভিটি ডায়াগনোসিস পদ্ধতি সরবরাহ করে যক্ষ্মা, এবং যক্ষ্মার সঠিক রোগ নির্ণয়, ওষুধ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ এবং চিকিত্সা সহায়তা করে। একই সময়ে, এটি পাওয়া যায় যে রোগীর প্লাজমা সিএফডিএনএ টিবিএম নির্ণয়ের ক্ষেত্রে ক্লিনিকাল স্যাম্পলিংয়ের জন্য উপযুক্ত নমুনা প্রকার হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে।
এই সমীক্ষায়, 227 প্লাজমা নমুনা এবং সেরিব্রোস্পাইনাল তরল নমুনা দুটি ক্লিনিকাল কোহোর্ট স্থাপনের জন্য ব্যবহৃত হয়েছিল, যেখানে পরীক্ষাগার ডায়াগনস্টিক কোহর্ট নমুনাগুলি যক্ষ্মা নির্ণয়ের মেশিন লার্নিং মডেল প্রতিষ্ঠার জন্য ব্যবহৃত হত এবং ক্লিনিকাল ডায়াগনস্টিক কোহর্ট নমুনাগুলি প্রতিষ্ঠিত প্রতিষ্ঠিত যাচাই করার জন্য ব্যবহৃত হয়েছিল ডায়াগনস্টিক মডেল। সমস্ত নমুনাগুলি প্রথমে মাইকোব্যাক্টেরিয়াম যক্ষ্মার জন্য একটি বিশেষভাবে ডিজাইন করা লক্ষ্যযুক্ত ক্যাপচার প্রোব পুল দ্বারা লক্ষ্যবস্তু করা হয়েছিল। তারপরে, টিবি-টিএনজিএস সিকোয়েন্সিং ডেটার উপর ভিত্তি করে, সিদ্ধান্ত ট্রি মডেলটি পরীক্ষাগার ডায়াগনস্টিক কাতারের প্রশিক্ষণ এবং বৈধতা সেটগুলিতে 5-ভাঁজ ক্রস-বৈধকরণ সম্পাদন করতে ব্যবহৃত হয় এবং প্লাজমা নমুনা এবং সেরিব্রোস্পাইনাল তরল নমুনাগুলির ডায়াগনস্টিক থ্রেশহোল্ডগুলি প্রাপ্ত হয়। প্রাপ্ত থ্রেশহোল্ডটি সনাক্তকরণের জন্য ক্লিনিকাল ডায়াগনোসিস কাতারের দুটি পরীক্ষার সেটগুলিতে আনা হয় এবং শিক্ষার্থীর ডায়াগনস্টিক পারফরম্যান্সটি আরওসি বক্ররেখা দ্বারা মূল্যায়ন করা হয়। অবশেষে, যক্ষ্মার রোগ নির্ণয়ের মডেলটি প্রাপ্ত হয়েছিল।
চিত্র 1 গবেষণা ডিজাইনের স্কিম্যাটিক ডায়াগ্রাম
ফলাফল: সিএসএফ ডিএনএ নমুনা (এউসি = 0.974) এবং প্লাজমা সিএফডিএনএ নমুনা (এউসি = 0.908) এর নির্দিষ্ট প্রান্তিকতা অনুসারে এই গবেষণায় নির্ধারিত, 227 নমুনার মধ্যে সিএসএফ নমুনার সংবেদনশীলতা ছিল 97.01%, নির্দিষ্টতা ছিল 95.65%এবং প্লাজমা নমুনার সংবেদনশীলতা এবং নির্দিষ্টতা ছিল 82.61% এবং 86.36%। টিবিএম রোগীদের কাছ থেকে প্লাজমা সিএফডিএনএ এবং সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড ডিএনএর 44 জোড়যুক্ত নমুনার বিশ্লেষণে, এই গবেষণার ডায়াগনস্টিক কৌশলটির প্লাজমা সিএফডিএনএ এবং সেরিব্রোস্পাইনাল ফ্লুইড ডিএনএতে 90.91% (40/44) এর উচ্চ ধারাবাহিকতা রয়েছে এবং সংবেদনশীলতা 95.45% (42/44)। পালমোনারি যক্ষ্মা শিশুদের মধ্যে, এই অধ্যয়নের ডায়াগনস্টিক কৌশল একই রোগীদের (28.57% বনাম 15.38%) থেকে গ্যাস্ট্রিক রস নমুনার এক্সপিআরটি সনাক্তকরণের ফলাফলের চেয়ে প্লাজমা নমুনার প্রতি বেশি সংবেদনশীল।
চিত্র 2 জনসংখ্যার নমুনাগুলির জন্য যক্ষ্মা নির্ণয়ের মডেলের বিশ্লেষণ পারফরম্যান্স
চিত্র 3 জোড়যুক্ত নমুনাগুলির ডায়াগনস্টিক ফলাফল
উপসংহার: এই গবেষণায় যক্ষ্মার জন্য একটি হাইপারস্পেনসিটিভ ডায়াগনস্টিক পদ্ধতি প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল, যা অলিগোব্যাসিলারি যক্ষ্মা (নেতিবাচক সংস্কৃতি) সহ ক্লিনিকাল রোগীদের জন্য সর্বাধিক সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা সহ একটি ডায়াগনস্টিক সরঞ্জাম সরবরাহ করতে পারে। প্লাজমা সিএফডিএনএর উপর ভিত্তি করে হাইপারস্পেনসিটিভ যক্ষ্মা সনাক্তকরণ সক্রিয় যক্ষ্মা এবং যক্ষ্মা মেনিনজাইটিস নির্ণয়ের জন্য উপযুক্ত নমুনা প্রকার হতে পারে (প্লাজমা নমুনাগুলি মস্তিষ্কের যক্ষ্মার সন্দেহযুক্ত রোগীদের জন্য সেরিব্রোস্পাইনাল তরল তুলনায় সংগ্রহ করা সহজ)।
আসল লিঙ্ক: https://www.scienderect.com/sticle/pii/s00098981230049990? %3 ডিহুবের মাধ্যমে
ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্ট যক্ষ্মা সিরিজ সনাক্তকরণ পণ্যগুলির সংক্ষিপ্ত পরিচিতি
যক্ষ্মা রোগীদের এবং বিভিন্ন প্রয়োজনের জটিল নমুনা পরিস্থিতি বিবেচনা করে, ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্ট স্পুটাম নমুনা, কোয়ালকম লাইব্রেরি নির্মাণ এবং সিকোয়েন্সিং এবং ডেটা বিশ্লেষণ থেকে তরল নিষ্কাশনের জন্য এনজিএস সমাধানের একটি সম্পূর্ণ সেট সরবরাহ করে। পণ্যগুলি যক্ষ্মা রোগীদের দ্রুত নির্ণয়, যক্ষ্মার ড্রাগ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ, মাইকোব্যাক্টেরিয়াম যক্ষ্মা এবং এনটিএম টাইপিং, ব্যাকটিরিয়া-নেতিবাচক যক্ষ্মা এবং যক্ষ্মা ব্যক্তিদের হাইপারস্পেনসিটিভিটি ডায়াগনোসিস ইত্যাদি অন্তর্ভুক্ত করে Covers
যক্ষ্মা এবং মাইকোব্যাকটিরিয়ার জন্য সিরিয়াল সনাক্তকরণ কিটস:
আইটেম নং | পণ্যের নাম | পণ্য পরীক্ষার সামগ্রী | নমুনা প্রকার | প্রযোজ্য মডেল |
এইচডব্লিউটিএস -3012 | নমুনা রিলিজ এজেন্ট | স্পুটাম নমুনাগুলির তরল চিকিত্সায় ব্যবহৃত, প্রথম শ্রেণির রেকর্ড নম্বর, সুতং যন্ত্রপাতি সরঞ্জাম 20230047 পেয়েছে। | স্পুটাম | |
এইচডব্লিউটিএস-এনজিএস-পি 100021 | হাইপারস্পেনসিটিভ যক্ষ্মার জন্য কোয়ালকম পরিমাণের সনাক্তকরণ কিট (প্রোব ক্যাপচার পদ্ধতি) | ব্যাকটিরিয়া-নেগেটিভ পালমোনারি যক্ষ্মা এবং মস্তিষ্কের নোডুলসের জন্য অ-আক্রমণাত্মক (তরল বায়োপসি) হাইপারস্পেনসিটিভিটি সনাক্তকরণ; যক্ষ্মা বা নন-টিউবারকোলোসিস মাইকোব্যাকটিরিয়ায় আক্রান্ত হওয়ার সন্দেহযুক্ত লোকদের নমুনাগুলি উচ্চ গভীরতার সিকোয়েন্সিং মেটাজেনোমিক্স দ্বারা বিশ্লেষণ করা হয়েছিল এবং যক্ষ্মা বা নন-টিউবারকোলোসিস মাইকোব্যাকটিরিয়াসের সনাক্তকরণের তথ্য সংক্রামিত হয়েছিল এবং মাইকোব্যাকটারিয়ামের মূল প্রথম-লাইনের ওষুধের প্রতিরোধের তথ্য সংক্রামিত হয়েছিল কিনা সরবরাহ করা হয়েছিল। | পেরিফেরিয়াল রক্ত, অ্যালভোলার ল্যাভেজ তরল, হাইড্রোথোরাক্স এবং অ্যাসাইটেস, ফোকাস পাঞ্চার নমুনা, সেরিব্রোস্পাইনাল তরল। | দ্বিতীয় প্রজন্ম |
HWTS-NGS-T001 | মাইকোব্যাক্টেরিয়াম টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ কিট (মাল্টিপ্লেক্স পরিবর্ধন সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি) | এমটিবিসি এবং 187 এনটিএম সহ মাইকোব্যাক্টেরিয়াম টাইপিং পরীক্ষা;মাইকোব্যাক্টেরিয়াম টিউবারকোলোসিসের ড্রাগ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ 13 টি ওষুধ এবং ড্রাগ প্রতিরোধের জিনের 16 টি মূল রূপান্তর সাইটগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করে। | স্পুটাম, অ্যালভোলার ল্যাভেজ তরল, হাইড্রোথোরাক্স এবং অ্যাসাইটেস, ফোকাস পাঞ্চার নমুনা, সেরিব্রোস্পাইনাল তরল। | দ্বিতীয়/তৃতীয় প্রজন্মের দ্বৈত প্ল্যাটফর্ম |
হাইলাইটস: এইচডব্লিউটিএস-এনজিএস-টি 1001 মাইকোব্যাক্টেরিয়াম টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ কিট (মাল্টিপ্লেক্স পরিবর্ধন পদ্ধতি)
পণ্য ভূমিকা
পণ্যটি ডাব্লুএইচও টিবি চিকিত্সা নির্দেশিকা, ম্যাক্রোলাইডস এবং অ্যামিনোগ্লাইকোসাইডগুলিতে সাধারণত এনটিএম চিকিত্সার নির্দেশিকাগুলিতে ব্যবহৃত হয় এবং ড্রাগ প্রতিরোধের সাইটগুলিতে ড্রাগ প্রতিরোধ-সম্পর্কিত সাইটগুলির সমস্ত একটি গ্রুপকে অন্তর্ভুক্ত করে প্রথম এবং দ্বিতীয়-লাইনের ওষুধের উপর ভিত্তি করে তৈরি করা হয় কে মাইকোব্যাক্টেরিয়াম যক্ষ্মা জটিল মিউটেশন ক্যাটালগ, পাশাপাশি অন্যান্য রিপোর্ট করা ড্রাগ প্রতিরোধের জিন এবং মিউটেশন সাইটগুলি তদন্ত এবং পরিসংখ্যান অনুসারে মিউটেশন সাইটগুলি দেশে এবং বিদেশে উচ্চ-স্কোরিং সাহিত্য।
টাইপিং সনাক্তকরণটি এনটিএম স্ট্রেনের উপর ভিত্তি করে এনটিএম গাইডলাইনগুলিতে সংক্ষিপ্ত করে চীনা জার্নাল অফ টিউবারকোলোসিস এবং শ্বাস প্রশ্বাসের রোগ এবং বিশেষজ্ঞদের sens কমত্য দ্বারা প্রকাশিত। ডিজাইন করা টাইপিং প্রাইমারগুলি 190 টিরও বেশি এনটিএম প্রজাতির প্রশস্তকরণ, ক্রম এবং টিকা দিতে পারে।
লক্ষ্যযুক্ত মাল্টিপ্লেক্স পিসিআর পরিবর্ধন প্রযুক্তির মাধ্যমে, মাইকোব্যাক্টেরিয়ামের জিনোটাইপিং জিন এবং ড্রাগ-প্রতিরোধী জিনগুলি মাল্টিপ্লেক্স পিসিআর দ্বারা প্রশস্ত করা হয়েছিল, এবং সনাক্ত করা লক্ষ্য জিনগুলির এমপ্লিকন সংমিশ্রণটি প্রাপ্ত হয়েছিল। পরিবর্ধিত পণ্যগুলি দ্বিতীয় প্রজন্মের বা তৃতীয় প্রজন্মের উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরিগুলিতে তৈরি করা যেতে পারে এবং লক্ষ্য জিনগুলির ক্রম সম্পর্কিত তথ্য পেতে সমস্ত দ্বিতীয় প্রজন্ম এবং তৃতীয়-প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মগুলি উচ্চ-গভীরতার সিকোয়েন্সিংয়ের শিকার হতে পারে। অন্তর্নির্মিত রেফারেন্স ডাটাবেসে থাকা পরিচিত মিউটেশনগুলির সাথে তুলনা করে (ডাব্লুএইচও মাইকোব্যাক্টেরিয়াম যক্ষ্মা জটিল মিউটেশন ক্যাটালগ এবং ড্রাগ প্রতিরোধের সাথে এর সম্পর্ক সহ), ড্রাগ প্রতিরোধের সাথে সম্পর্কিত রূপান্তর বা অ্যান্টি-টিউবারকোলোসিস ড্রাগের সংবেদনশীলতা নির্ধারণ করা হয়েছিল। ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-পরীক্ষার স্ব-খোলা স্পুটাম নমুনা চিকিত্সার সমাধানের সাথে একত্রিত, ক্লিনিকাল স্পুটাম নমুনাগুলির কম নিউক্লিক অ্যাসিড পরিবর্ধনের দক্ষতার সমস্যা (traditional তিহ্যবাহী পদ্ধতির চেয়ে দশগুণ বেশি) সমাধান করা হয়েছিল, যাতে ড্রাগ প্রতিরোধের সিকোয়েন্সিং সনাক্তকরণ হতে পারে সরাসরি ক্লিনিকাল স্পুটাম নমুনায় প্রয়োগ করা হয়।
পণ্য সনাক্তকরণ পরিসীমা
34এর ড্রাগ প্রতিরোধ সম্পর্কিত জিন18অ্যান্টি-টিউবারকোলোসিস ড্রাগ এবং6এনটিএম ড্রাগগুলি সনাক্ত করা হয়েছিল, কভারিং297ড্রাগ প্রতিরোধের সাইট; দশ ধরণের মাইকোব্যাক্টেরিয়াম যক্ষ্মা এবং এর চেয়ে বেশি190ধরণের এনটিএম সনাক্ত করা হয়েছিল।
সারণী 1: 18+6 ড্রাগের তথ্য+190+এনটিএম
পণ্য সুবিধা
শক্তিশালী ক্লিনিকাল অভিযোজনযোগ্যতা: সংস্কৃতি ছাড়াই স্ব-তরলকরণ এজেন্টের সাথে স্পুটাম নমুনাগুলি সরাসরি সনাক্ত করা যায়।
পরীক্ষামূলক অপারেশনটি সহজ: প্রশস্তকরণ অপারেশনের প্রথম রাউন্ডটি সহজ এবং গ্রন্থাগার নির্মাণ 3 ঘন্টার মধ্যে সম্পন্ন হয়, যা কাজের দক্ষতা উন্নত করে।
বিস্তৃত টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধের: এমটিবি এবং এনটিএমের টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধের সাইটগুলি covering েকে রাখা, যা ক্লিনিকাল উদ্বেগ, সঠিক টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ, স্বতন্ত্র বিশ্লেষণ সফ্টওয়্যারকে সমর্থন করে এবং এক ক্লিকের মাধ্যমে বিশ্লেষণ প্রতিবেদন তৈরি করার মূল বিষয়।
সামঞ্জস্যতা: পণ্যের সামঞ্জস্যতা, মূলধারার আইএলএম এবং এমজিআই/ওএনটি প্ল্যাটফর্মগুলির সাথে খাপ খাইয়ে নেওয়া।
পণ্য স্পেসিফিকেশন
পণ্য কোড | পণ্যের নাম | সনাক্তকরণ প্ল্যাটফর্ম | স্পেসিফিকেশন |
HWTS-NGS-T001 | মাইকোব্যাক্টেরিয়াম টাইপিং এবং ড্রাগ প্রতিরোধ সনাক্তকরণ কিট (মাল্টিপ্লেক্স পরিবর্ধন পদ্ধতি) | অন্ট 、 ইলুমিনা 、 এমজিআই 、 সালাস প্রো | 16/96RXN |
পোস্ট সময়: জানুয়ারী -23-2024