হেইলংজিয়াং-এ ইঁদুর "প্যাথোজেন ব্যাংক" উন্মোচন: লাসা এবং হান্টাভাইরাস সহ মূল প্যাথোজেন সনাক্তকরণ

সাম্প্রতিক এক মেটাজেনমিক গবেষণায় হেইলংজিয়াং প্রদেশে ইঁদুর দ্বারা বাহিত ভাইরাস এবং ব্যাকটেরিয়ার একটি উল্লেখযোগ্য বৈচিত্র্যময় বর্ণালী প্রকাশ পেয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে লাসা ভাইরাস, আমুর ভাইরাস, সালমোনেলা এবং ইয়ারসিনিয়া পেস্টিস।

গবেষণায় ব্যবহার করা হয়েছেম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্ট থেকে প্যাথোজেন আরএনএ সমৃদ্ধকরণ কিটপ্রোব ক্যাপচার প্রযুক্তির উপর ভিত্তি করে। হোস্ট আরআরএনএ এবং অন্যান্য সংরক্ষিত হোস্ট টুকরোগুলিকে বেছে বেছে হ্রাস করে, পদ্ধতিটি কার্যকরভাবে মাইক্রোবিয়াল আরএনএ ধরে রেখেছে, যা প্যাথোজেন সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করেছে। এই প্যাথোজেন আরএনএ সমৃদ্ধকরণ পদক্ষেপটি উচ্চ সনাক্তকরণ হার অর্জনের জন্য গুরুত্বপূর্ণ ছিল এবং প্যাথোজেন নজরদারির জন্য শক্তিশালী প্রযুক্তিগত সহায়তা প্রদান করেছিল।

ইঁদুর: জুনোটিক রোগের মূল আধার

ইঁদুর হল স্তন্যপায়ীদের মধ্যে সবচেয়ে প্রজাতি সমৃদ্ধ এবং ব্যাপকভাবে বিতরণ করা দল, যাদের বিশ্বব্যাপী ২,০০০ এরও বেশি প্রজাতি রয়েছে এবং সমস্ত স্তন্যপায়ী প্রজাতির ৪০% এরও বেশি।

পরিবেশগত গুরুত্বের বাইরেও, ইঁদুরগুলি অসংখ্য জুনোটিক রোগজীবাণুর প্রধান আধার এবং বাহক হিসেবে কাজ করে।যেহেতু ইঁদুরের আবাসস্থল প্রায়শই মানুষের পরিবেশের সাথে মিশে যায় - সরাসরি কামড়ের মাধ্যমে, মলমূত্রের সংস্পর্শে, অথবা মাছি এবং মাইটের মাধ্যমে পরোক্ষ সংক্রমণের মাধ্যমে - তাদের জীবাণুগুলি জনস্বাস্থ্যের জন্য স্থায়ী হুমকি তৈরি করে।

উল্লেখযোগ্যভাবে, ৭০% এরও বেশি উদ্ভূত সংক্রামক রোগ বন্যপ্রাণী থেকে উদ্ভূত হয়, যার মধ্যে ইঁদুরগুলি সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ ভাইরাল আধারগুলির মধ্যে একটি।

হেইলংজিয়াং সীমান্ত অঞ্চল: রোগজীবাণু নজরদারির জন্য একটি সম্মুখ রেখা

উত্তর-পূর্ব চীনের সীমান্তবর্তী প্রদেশ হেইলংজিয়াং, প্রচুর পরিবেশগত সম্পদের অধিকারী এবং একাধিক দেশের সাথে সীমানা ভাগ করে নেয়। সমৃদ্ধ জীববৈচিত্র্য এবং ঘন ঘন আন্তঃসীমান্ত জনসংখ্যার চলাচলের সমন্বয় রোগজীবাণু সংক্রমণের জন্য অনুকূল পরিস্থিতি তৈরি করে।

২০২১ সালের জুন থেকে জুলাই মাসের মধ্যে, গবেষকরা মুদানজিয়াং শহরের হেংদাওহেজি শহর থেকে ৬৭টি বন্য ইঁদুর সংগ্রহ করেছিলেন। নমুনাগুলির মধ্যে রয়েছে:

l ২০অ্যাপোডেমাস উপদ্বীপ

l ৪৭মায়োডস রুফোকানাস

সমস্ত নমুনা আবাসিক এলাকা এবং আশেপাশের কৃষিজমি থেকে ধারণ করা হয়েছিল, যা মানব বসতি এবং বন্যপ্রাণীর আবাসস্থলের মধ্যে ঘনিষ্ঠ যোগাযোগ তুলে ধরে।

রোগজীবাণু সমৃদ্ধকরণ প্রযুক্তি: হোস্ট পটভূমির হস্তক্ষেপ কাটিয়ে ওঠা

মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিংয়ে, হোস্ট আরএনএ সাধারণত সিকোয়েন্সিং রিডের উপর প্রাধান্য পায়, কম-প্রাচুর্যের প্যাথোজেন সংকেতগুলিকে আড়াল করে।

এই চ্যালেঞ্জ মোকাবেলা করার জন্য, গবেষণায় ব্যবহৃত হয়েছেম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্টের প্যাথোজেন মেটাজেনমিক ডিটেকশন কিট। প্রোব ক্যাপচার প্রযুক্তি ব্যবহার করে, বিশেষভাবে ডিজাইন করা প্রোবগুলি rRNA এবং সংরক্ষিত ক্রমগুলির সাথে আবদ্ধ হয়, যা তাদের হ্রাসকে সক্ষম করে এবং এর ফলে মাইক্রোবিয়াল RNA সমৃদ্ধ করে।

এই পদ্ধতিটি রোগজীবাণু সনাক্তকরণের সংবেদনশীলতাকে উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করেছে, যার ফলে ডাউনস্ট্রিম সিকোয়েন্সিংয়ে রোগজীবাণু পাঠের উচ্চ অনুপাত পুনরুদ্ধার করা সম্ভব হয়েছে। সমৃদ্ধকরণ পদক্ষেপটি ইঁদুর দ্বারা বাহিত রোগজীবাণু বর্ণালীকে সঠিকভাবে চিহ্নিত করার জন্য একটি শক্ত ভিত্তি স্থাপন করেছে।

সমৃদ্ধকরণের পর, RNA নমুনাগুলি বিপরীত প্রতিলিপি, গ্রন্থাগার নির্মাণ এবং উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংয়ের মধ্য দিয়ে যায়। জৈব তথ্য বিশ্লেষণের মধ্যে রয়েছে:

l হোস্ট জিনোম ফিল্টারিং

l Kraken2 ব্যবহার করে ট্যাক্সোনমিক শ্রেণীবিভাগ

l ব্র্যাকেন দিয়ে প্রাচুর্য সংশোধন

এই কর্মপ্রবাহটি ভাইরাল এবং ব্যাকটেরিয়া সম্প্রদায়ের একটি বিস্তৃত প্রোফাইল তৈরি করেছে।

গবেষণার ফলাফল: একাধিক ভাইরাস এবং ব্যাকটেরিয়ার সহ-সঞ্চালন

ভাইরাল তথ্য

সনাক্ত হওয়া ভাইরাসগুলি 21টি ভাইরাল পরিবারের অন্তর্ভুক্ত, যার মধ্যে রয়েছেঅ্যারেনাভিরিডেএবংহান্তাভিরিডে.

মাধ্যমেনতুন করেমেগাহিট ব্যবহার করে অ্যাসেম্বলি করার মাধ্যমে, ১৫৪টি ভাইরাল কনটিগ তৈরি করা হয়েছিল, যার মধ্যে ১১০টি আটটি পরিবারের ১৯টি ভাইরাসের সাথে সংযুক্ত ছিল।

In অ্যাপোডেমাস উপদ্বীপ, নিম্নলিখিত ভাইরাসগুলি সনাক্ত করা হয়েছে:

l অ্যারেনাভাইরাস: লাসা ভাইরাস, ওয়েনজু ভাইরাস, গাইরো ভাইরাস

l হান্টাভাইরাস: আমুর ভাইরাস, পুউমালা ভাইরাস

In মায়োডস রুফোকানাস, ইঁদুরের আর্টেরিভাইরাস এবং আমুর ভাইরাস সনাক্ত করা হয়েছে।

এই রোগজীবাণুগুলির মধ্যে:

লাসা ভাইরাস ভাইরাল হেমোরেজিক জ্বরের একটি কার্যকারক, যার ক্ষেত্রে মৃত্যুর হার প্রায় ২০%।

l আমুর ভাইরাস হল হেমোরেজিক জ্বর উইথ রেনাল সিনড্রোম (HFRS) এর জন্য দায়ী একটি রোগজীবাণু। চীনে হান্টাভাইরাস সংক্রমণের পরিমাণ সবচেয়ে বেশি।

ব্যাকটেরিয়া সংক্রান্ত তথ্য

মোট ১,০৫১টি ব্যাকটেরিয়া জেনার টীকাভুক্ত করা হয়েছিল।

সবচেয়ে প্রাচুর্যপূর্ণ প্রজাতি ছিল:

আমিসালমোনেলা(২৬-৩১%)

আমিইয়েরসিনিয়া(১১-২৩%)

সালমোনেলাএটি একটি প্রধান খাদ্যবাহিত রোগজীবাণু, যা বিশ্বব্যাপী আনুমানিক ৯০ লক্ষ টাইফয়েড জ্বরের ঘটনা এবং বার্ষিক প্রায় ১,১০,০০০ মৃত্যুর জন্য দায়ী।

ইয়েরসিনিয়া পেস্টিসপ্লেগের কার্যকারক, তিনটি ঐতিহাসিক মহামারীর জন্য দায়ী। হেইলংজিয়াং প্রদেশ চীনের প্রাকৃতিক প্লেগ কেন্দ্রগুলির মধ্যে একটি হিসাবে স্বীকৃত এবং প্লেগ নজরদারির জন্য একটি অগ্রাধিকারপ্রাপ্ত অঞ্চল হিসেবে রয়ে গেছে।

অধ্যয়নের তাৎপর্য

বৈজ্ঞানিক অবদান

এই গবেষণাটি হেইলংজিয়াংয়ের ইঁদুরের মধ্যে লাসা ভাইরাসের টুকরো এবং ইঁদুরের ধমনী প্রদাহ ভাইরাসের প্রথম প্রতিবেদন উপস্থাপন করে, যা চীনের ইঁদুর-বাহিত রোগজীবাণু ডাটাবেসকে প্রসারিত করে।

এটি স্থানীয় ইঁদুর জনগোষ্ঠীর ভাইরাল এবং ব্যাকটেরিয়া সম্প্রদায়গুলিকে পদ্ধতিগতভাবে চিহ্নিত করে, সীমান্তবর্তী অঞ্চলে জুনোটিক রোগ নজরদারির জন্য বেসলাইন ডেটা সরবরাহ করে।

জনস্বাস্থ্যের প্রভাব

এই অনুসন্ধানগুলি ক্রমাগত নজরদারি এবং রোগজীবাণু স্ক্রিনিংয়ের প্রয়োজনীয়তা তুলে ধরেA. উপদ্বীপএবংএম. রুফোকানাস.

এই তথ্যগুলি রেনাল সিনড্রোম সহ প্লেগ এবং হেমোরেজিক জ্বরের মতো রোগের উৎস নিয়ন্ত্রণ কৌশলগুলিকে সমর্থন করে এমন বৈজ্ঞানিক প্রমাণ সরবরাহ করে।

পদ্ধতিগত শক্তি

মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিং পরিচিত এবং নতুন উভয় ধরণের রোগজীবাণুকেই নিরপেক্ষভাবে সনাক্ত করতে সক্ষম করে।

এই গবেষণায়, ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্টের প্যাথোজেন সমৃদ্ধকরণ প্রযুক্তি শক্তিশালী কর্মক্ষমতা প্রদর্শন করেছে, জটিল জৈবিক নমুনাগুলিতে লক্ষ্য প্যাথোজেন সনাক্তকরণকে কার্যকরভাবে উন্নত করেছে। ফলাফলগুলি বন্যপ্রাণী নজরদারিতে উচ্চ-সংবেদনশীলতা প্যাথোজেন সনাক্তকরণকে সমর্থন করার ক্ষমতা নিশ্চিত করে।

পণ্যের সুপারিশ

এই গবেষণায় এর সফল প্রয়োগের উপর ভিত্তি করে, মেটাজেনমিক নজরদারি গবেষণার জন্য ম্যাক্রো এবং মাইক্রো-টেস্ট প্যাথোজেন আরএনএ সমৃদ্ধকরণ কিট অত্যন্ত সুপারিশ করা হয়।

দক্ষতার সাথে হোস্ট নিউক্লিক অ্যাসিড হ্রাস করে এবং মাইক্রোবায়াল সিকোয়েন্স সমৃদ্ধ করে, কিটটি সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা এবং ডেটার মান উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করে। জটিল নমুনাগুলিতে সঠিক রোগজীবাণু আবিষ্কারের জন্য এটি একটি অপরিহার্য হাতিয়ার এবং জনস্বাস্থ্য নজরদারি, জুনোটিক ঝুঁকি মূল্যায়ন এবং প্রাদুর্ভাবের প্রস্তুতির জন্য শক্তিশালী প্রযুক্তিগত সহায়তা প্রদান করে।

Contact to learn more: marketing@mmtest.com