ঝেজিয়াং প্রদেশে ব্রুসেলা অ্যাবোরটাস-এর প্রথম পূর্ণাঙ্গ জিনোম-ভিত্তিক শনাক্তকরণযোগ্যতা বিশ্লেষণ – ম্যাক্রো ও মাইক্রো-টেস্ট-এর বায়োইনফরমেটিক্স দল যৌথ প্রকাশনায় অবদান রেখেছে

ঝেজিয়াং সিডিসি, ম্যাক্রো অ্যান্ড মাইক্রো-টেস্ট এবং চায়না সিডিসি-র যৌথ গবেষণা ফ্রন্টিয়ার্স ইন সেলুলার অ্যান্ড ইনফেকশন মাইক্রোবায়োলজি-তে প্রকাশিত হয়েছে।

অধ্যয়নের সংক্ষিপ্ত বিবরণ

২০২৬ সালের মে মাসে, ঝেজিয়াং প্রাদেশিক রোগ নিয়ন্ত্রণ ও প্রতিরোধ কেন্দ্র (ঝেজিয়াং সিডিসি)-এর নেতৃত্বে এবং বেইজিং ম্যাক্রো অ্যান্ড মাইক্রো-টেস্ট বায়ো-টেক কোং, লিমিটেড-এর বায়োইনফরমেটিক্স দল ও জাতীয় সংক্রামক রোগ নিয়ন্ত্রণ ও প্রতিরোধ ইনস্টিটিউট (চায়না সিডিসি)-কে সহ-লেখক হিসেবে নিয়ে ‘ফ্রন্টিয়ার্স ইন সেলুলার অ্যান্ড ইনফেকশন মাইক্রোবায়োলজি’ (জেসিআর কিউ১, আইএফ ≈ ৪.৬) জার্নালে একটি গবেষণাপত্র প্রকাশিত হয়। গবেষণাটির শিরোনাম হলো:
চীনের ঝেজিয়াং-এ প্রাপ্ত সাতটি ব্রুসেলা অ্যাবোরটাস স্ট্রেইনের শনাক্তকরণ এবং ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ।

এই গবেষণাটি চীনের ঝেজিয়াং প্রদেশে ব্রুসেলা অ্যাবোরটাস (বি. অ্যাবোরটাস)-এর প্রথম পদ্ধতিগত, সম্পূর্ণ জিনোম-ভিত্তিক ফাইলোজেনেটিক ট্রেসেবিলিটি বিশ্লেষণ। দলটি ২০১৫ থেকে ২০২৫ সালের মধ্যে সংগৃহীত সাতটি আইসোলেট বিশ্লেষণ করেছে (জিনহুয়া, কুঝো এবং নিংবো থেকে সংগৃহীত চারটি মানব-উৎস এবং তিনটি গবাদি-উৎস স্ট্রেইন)। এই গবেষণার ফলাফল পূর্ব চীনের একটি অস্বাভাবিক দক্ষিণাঞ্চলীয় মহামারী অঞ্চলে এই “উত্তরাঞ্চলীয় প্রভাবশালী প্রজাতি”-র উৎস এবং সংক্রমণ পথের জিনোমিক প্রমাণ সরবরাহ করে।

পটভূমি এবং তাৎপর্য

ব্রুসেলোসিস হলো ব্রুসেলা গণের ব্যাকটেরিয়া দ্বারা সৃষ্ট একটি প্রাণিবাহিত রোগ। ব্রুসেলা অ্যাবোরটাস প্রধানত গবাদি পশুকে সংক্রমিত করে, তবে এটি মানুষের মধ্যেও রোগ সৃষ্টি করতে পারে। চীনে ব্রুসেলোসিসের ক্ষেত্রে উল্লেখযোগ্য ভৌগোলিক ভিন্নতা দেখা যায়: এর প্রকোপ সবচেয়ে বেশি উত্তরের প্রদেশগুলিতে (যেমন, ইনার মঙ্গোলিয়া, শানসি, হেইলংজিয়াং)। এর বিপরীতে, ঝেজিয়াং সহ দক্ষিণের প্রদেশগুলিতে ঐতিহাসিকভাবে ব্রুসেলা মেলিটেনসিসের প্রাধান্য ছিল এবং সেখানে বি. অ্যাবোরটাসের ঘটনা খুব কমই নথিভুক্ত হয়েছে। এই আঞ্চলিক বৈষম্যের কারণে ঝেজিয়াং-এ বি. অ্যাবোরটাসের জিনগত বৈশিষ্ট্য নিরূপণ এবং এর উৎস সন্ধান একটি প্রধান জনস্বাস্থ্য অগ্রাধিকার হয়ে উঠেছে।

পদ্ধতি এবং মূল ফলাফল

গবেষণা দলটি আণবিক জীববিজ্ঞান এবং বায়োইনফরমেটিক্সকে একত্রিত করে একটি বহুমুখী কৌশল গ্রহণ করেছে:

1.রোগজীবাণু শনাক্তকরণ এবং প্রাথমিক টাইপিং

BCSP-31 জিন PCR এবং AMOS-PCR দ্বারা নিশ্চিত করা হয়েছে যে সাতটি আইসোলেটই B. abortus ছিল।

নয়টি হাউসকিপিং জিনের উপর ভিত্তি করে মাল্টিলোকাস সিকোয়েন্স টাইপিং (MLST) থেকে জানা যায় যে, সমস্ত আইসোলেট ST2 সিকোয়েন্স টাইপের অন্তর্গত, যা ঝেজিয়াং-এ প্রচলিত B. abortus স্ট্রেনগুলির মধ্যে উচ্চ জিনগত সমরূপতা নির্দেশ করে।

2.সম্পূর্ণ জিনোম বৈশিষ্ট্যকরণ

ইলুমিনা নোভা সিক প্ল্যাটফর্মে সম্পূর্ণ জিনোম সিকোয়েন্সিং করা হয়েছিল। গড় নিউক্লিওটাইড আইডেন্টিটি (এএনআই) বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে ঝেজিয়াং আইসোলেটগুলি রেফারেন্স স্ট্রেইন বি. অ্যাবোরটাস ৫৪৪-এর সাথে ৯৯.৯৯% পর্যন্ত সাদৃশ্যপূর্ণ।

সর্ব-জিনোম বিশ্লেষণে একটি অত্যন্ত সংরক্ষিত জনগোষ্ঠী প্রকাশ পেয়েছে: ৩,০৮৪টি কোর জিন এবং মাত্র ১০টি শেল জিন শনাক্ত করা হয়েছে, এবং কোনো সফট কোর বা ক্লাউড জিন সনাক্ত করা যায়নি।

3.ভাইরাসের তীব্রতা এবং অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল প্রতিরোধ জিনের প্রোফাইল

মোট ৬৮টি রোগ সৃষ্টিকারী উপাদান শনাক্ত করা হয়েছে, যার মধ্যে LPS জৈব সংশ্লেষণ, T4SS নিঃসরণ ব্যবস্থা এবং BvrR-BvrS দ্বি-উপাদান নিয়ন্ত্রক ব্যবস্থার মতো চিরায়ত পথগুলো অন্তর্ভুক্ত। লক্ষণীয়ভাবে, সমস্ত আইসোলেটে bmaA এবং btaF নামক অ্যাডহেসিন জিনগুলোর অভাব ছিল। প্রতিরোধ জিন বিশ্লেষণে CARD ডেটাবেসে শুধুমাত্র mprF জিনটি শনাক্ত করা গেছে এবং অন্য কোনো প্রতিরোধ নির্ধারক চিহ্নিত করা যায়নি।

৪. ফাইলোজেনেটিক পুনর্গঠন এবং সংক্রমণ সনাক্তকরণ

কোর-জিনোম সিঙ্গেল-নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (cgSNP) বিশ্লেষণ ঝেজিয়াং আইসোলেটগুলোকে বৈশ্বিক ফাইলোজেনেটিক ট্রি-তে একটি নির্দিষ্ট অবস্থানে স্থাপন করেছে। ফলাফল থেকে দেখা যায় যে, ঝেজিয়াং স্ট্রেইনগুলো রাশিয়া, মঙ্গোলিয়া এবং উত্তর চীনের কয়েকটি প্রদেশের (নিংজিয়া, হেইলংজিয়াং, ইনার মঙ্গোলিয়া, হেবেই, গানসু, বেইজিং) স্ট্রেইনগুলোর সাথে মিলে একটি মনোফাইলেটিক গ্রুপ গঠন করে। এই গ্রুপটি আরও তিনটি স্বতন্ত্র সাব-ক্লেডে (ক্লেড ১-৩) বিভক্ত হয়, যা একাধিক স্বাধীন অনুপ্রবেশের ঘটনার ইঙ্গিত দেয়।

উপসংহার এবং প্রভাব

এই গবেষণাটি ঝেজিয়াং প্রদেশে B. abortus-এর প্রথম উচ্চ নির্ভুল জিনোমিক ডেটাসেট প্রদান করে এবং বেশ কিছু গুরুত্বপূর্ণ সিদ্ধান্তে উপনীত হয়েছে:

1. ক্লেar জেনেটিক পটভূমি– ঝেজিয়াং-এ প্রচলিত B. abortus স্ট্রেনগুলি ST2 শ্রেণীর অন্তর্গত, জিনগতভাবে অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং গবাদি পশুর ব্রুসেলোসিসের একটি আদর্শ বংশধারার প্রতিনিধিত্ব করে।

2. ইভিআন্তঃআঞ্চলিক সংক্রমণের ঘনত্ব– ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ ঝেজিয়াং-এ একটি স্বাধীন স্থানিক বংশধারার অস্তিত্বকে সমর্থন করে না। বরং, উপাত্তগুলো জোরালোভাবে ইঙ্গিত দেয় যে এই স্ট্রেইনগুলোর উৎপত্তি উত্তর চীন থেকে এবং রাশিয়া ও মঙ্গোলিয়ার স্ট্রেইনগুলোর সাথে এদের একটি সাধারণ বিবর্তনীয় পটভূমি থাকতে পারে। তিনটি উপ-ক্লেডের উপস্থিতি একাধিক পৃথক অনুপ্রবেশ ঘটনার ইঙ্গিত দেয়।

3. জনস্বাস্থ্যগত প্রভাবএই গবেষণার ফলাফল ঝেজিয়াং-এর মতো ঐতিহ্যগতভাবে অ-স্থানিক অঞ্চলেও ব্রুসেলোসিসের জন্য জিনোমিক নজরদারির গুরুত্ব তুলে ধরে। যদিও বর্তমান আক্রান্তের সংখ্যা কম, cgSNP-এর মতো উচ্চ রেজোলিউশনের টুলগুলো বাইরে থেকে আসা প্রাদুর্ভাবের উৎস কার্যকরভাবে শনাক্ত করতে পারে এবং আন্তঃপ্রাদেশিক পশু পরিবহনের সাথে যুক্ত সংক্রমণ শৃঙ্খল ভাঙার জন্য বৈজ্ঞানিক প্রমাণ সরবরাহ করতে পারে।

এই কাজটি শুধু ঝেজিয়াং প্রদেশের গবেষণার শূন্যতাই পূরণ করে না, বরং ইয়াংজি নদী ব-দ্বীপ অঞ্চলে ব্রুসেলোসিসের রোগজীবাণু নজরদারি এবং ঝুঁকি মূল্যায়নের জন্য নতুন ভিত্তিগত তথ্যও প্রদান করে।

কাগজের তথ্য:
ইয়াং, ওয়াই., শি, এক্স., চেন, জে., ওয়াং, এল., উ, জেড., ইয়াও, ডব্লিউ., … এবং উ, বি. (২০২৬)। চীনের ঝেজিয়াং-এ সাতটি ব্রুসেলা অ্যাবোরটাস স্ট্রেইনের শনাক্তকরণ এবং ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণ। ফ্রন্টিয়ার্স ইন সেলুলার অ্যান্ড ইনফেকশন মাইক্রোবায়োলজি, ১৬, ১৭৫৮৯৬৫।